เนื่องจากความน่าเชื่อถือของระบบ CNC สมัยใหม่เพิ่มมากขึ้นเรื่อยๆ ความผิดพลาดของระบบ CNC เองจึงลดลงเรื่อยๆ และความผิดพลาดส่วนใหญ่เกิดจากสาเหตุที่ไม่ใช่ระบบความผิดปกติภายนอกของระบบส่วนใหญ่อ้างถึงปัญหาที่เกิดจากสวิตช์ตรวจจับ ส่วนประกอบไฮดรอลิก ส่วนประกอบนิวเมติก ส่วนประกอบกระตุ้นไฟฟ้า อุปกรณ์ทางกล ฯลฯ
ข้อบกพร่องภายนอกของอุปกรณ์ควบคุมเชิงตัวเลขสามารถแบ่งออกเป็นข้อบกพร่องของซอฟต์แวร์และข้อผิดพลาดที่เกิดจากความเสียหายของฮาร์ดแวร์ภายนอก
ข้อบกพร่องที่อ่อนนุ่มเกิดจากการทำงานและการปรับที่ไม่เหมาะสมข้อผิดพลาดดังกล่าวมักเกิดขึ้นในช่วงแรกของการใช้อุปกรณ์หรือในช่วงระยะเวลาการปรับผู้ใช้อุปกรณ์
สำหรับระบบ CNC อีกจุดหนึ่งที่อาจเกิดปัญหาคือเซอร์โวยูนิตเนื่องจากการเคลื่อนที่ของแต่ละแกนเกิดขึ้นจากหน่วยเซอร์โวที่ควบคุมเซอร์โวมอเตอร์เพื่อขับเคลื่อนบอลสกรู
ตัวเข้ารหัสแบบโรตารี่ใช้สำหรับป้อนกลับความเร็ว และไม้บรรทัดตะแกรงใช้สำหรับป้อนกลับตำแหน่งโดยทั่วไป โมดูลการขับเคลื่อนของตัวเข้ารหัสแบบโรตารี่และเซอร์โวยูนิตมีแนวโน้มที่จะเกิดความล้มเหลว
นอกจากนี้ยังมีความโกลาหลของแต่ละระบบที่เกิดจากแหล่งจ่ายไฟโดยเฉพาะอย่างยิ่งสำหรับระบบที่มีฮาร์ดดิสก์คอมพิวเตอร์เพื่อบันทึกข้อมูล